甘孜州藏医院成立于1984年，集藏医医疗、教学、科研、藏药制剂生产为一体的综合性三级乙等公立医院，是国家级重点民族医院、全州藏医药业务技术指导中心、藏药制剂中心、四川省藏医药人才培训和临床实习基地，2022年7月经四川省委编办同意挂牌四川省藏医医院。2006年“甘孜州南派藏医药“被国务院列为首批“国家级非物质文化选产"，2011年甘孜州藏医院被确定为南派藏医药传习所"，2019年7月被四川省文化和旅游厅确定为四川省非物资文化选产项目体验基地、2024年评为全国中医药文化宣传教育基地。2023年成功获批四川省省级专家工作站。先后荣获四川省中医药发展先进集体、全省卫生系统先进集体、民族医药工作先进集体、四川省精品藏医院等荣誉称号:
医院现有职工160余人，其中专业技术二级专家2名，高级职称专技人员22人，中级职称专技人员19人;硕士研究生6人本科学历112人;享受国务院特殊津贴专家3人，国家级藏医药学术经验继承人5名、省级12名，"西部之光”访问学者2人，四川省学术技术带头人3人，四川省中医药系统学术技术带头人2人、后备人选各3人。拥有CT、全自动生化分析仪等先进医疗设备。编制床位300张，开放床位160张。设有13个职能科室和19个临床、医技科室。现有胃病、风湿病等国家级重点专科5个(包括腰椎病科正在建设1个)，药浴、治未病2个省级重点专科。国家级、省级名医工作室。年门诊量达6万余人次，年收治住院病人达2000余
人次。医院坚持以提言临床疗效为核心，以藏医类风湿病、睥胃病、内分泌(糖尿病)、藏药浴、老年病科等国家、省、州级重点专病专科为龙头，着力打造治未病、治慢病、藏医外治等藏医特色科室，充分发挥藏医药在治疗慢性病、康复保健方面的特色优
势。蛋院坚持医药并重，积极推进藏药制剂规范化生产。制定藏药制剂质量标准200余个，169个藏药制剂取得省食药监局制剂备案文号，研制生产名表藏成药18种，常用藏成药200余种，年生产藏药制剂达50余吨，为全省各级藏医医疗机构临床用药提供了保障医院收集藏医药文献200余部，制作藏医药科研教学曼唐挂图80幅。建设南派藏医药展厅1个。承担国家、省、州各级科研课题70余项。获得藏药发明专利3项，注册藏药商标2个。开发藏药新产品10余个(其中藏药新药"然峰多吉"获得国家药品批准文号和新药证书)。国家级课题"四川省民族医药文献暨特色诊疗技术的系统挖掘与传应用示范“获得四川省科技进步二等奖、“藏药·佐塔·中汞的作用特点和安全性研究成果"获四川省人民政府科技进步三等奖。
医院始终坚持传承千年藏医药文化精髓，以核心理论彰显藏医药独特智慧;创新服务理念和发展方式，增强藏医药与时俱进生命力;探索藏医医院发展规律，拓展多维发展空间的思路，努力建设一流的藏医医院。