正蓝旗蒙医医院始建于1987年1月，2015年被评为二级甲等蒙医医院，是一所集医疗、保健、教学、康复为一体的以蒙医特色为主的甲等蒙医医院，是旗医保、新农合定点医院。全盟中蒙医医院分级管理“示范单位”，连续五年被评为盟级文明建设“标兵单位”
正蓝旗蒙医医院于2014年12月1日搬迁至现址，新建医院占地面积6400㎡，建筑面积6300m，业务用房面积6000m。全院现有职工80人、其中国家正式职工40人、公益性岗位4人，临时聘用人员38人，借调人员1名，全院卫生专业技术人员64名，占全院职工的80%。(其中蒙医师30人、西医师2人、执业护士13人、蒙药师7、医技人员12人、)蒙医药人员占全院职工的64.%。现有主任医师5名、副主任医师10名、中级职称医护人员15名，初级职称医护人员34名。
正蓝旗蒙医医院设传统疗术科(五疗科)、肝胆病科、蒙藏内科、心肾病科、脾胃病科等11个一级临床科室，其中蒙医妇科被评为自治区重点专科、蒙医康复五疗科、蒙医肝胆病科、蒙医心肾内科被评为盟级重点专科。设检验科、药剂科、放射科等8个医技科室及9个行政职能科室。医院拥有飞利浦彩超机、数字胃镜机，全自动生化仪、DR等先进医疗设备30余种。

正蓝旗蒙医医院以蒙医为主要发展方向，辅设西医重点突出民族医院特色。近3年平均年门诊人次42000余人次，蒙医门诊人次24000余人次，门诊蒙医治疗率96%，蒙医药收入占全部业务收入的86%，病床编制150张，开展床位80张，年均住院病人496余人次，住院蒙医治疗率86%
正蓝旗蒙医医院蒙药制剂室2016年12月顺利通过国家医疗机构制剂许可证换证验收工作，新建蒙药制剂室面积850㎡，功能齐全、结构合理，基本上达到了自治区中蒙医医院制剂室建设标准。内设:原料库、粉碎室、破碎室、打丸室、烘干室、包装室、消毒室、化验室等。蒙药制剂常用设备比较完善，配备有粉碎机、打丸机、包装机等10余种机型。年生产蒙药品种130多种，年可生产加工蒙药4000kg。

正蓝旗蒙医医院住院部设有3个独立护理单元，各护理单元配置有中心供氧、负压吸引、呼叫系统等配套设施，为患者诊疗康复提供了整洁、美观、舒适的就医环境。