西乌珠穆沁旗医院始建于1953年,前身是“东部联合旗卫生院”。1985年地方投资新建2400平方米病房楼,病床增至80张,1997年接受内蒙、锡盟等级医院评审委员会的审评,被评授为二级乙等医院(原为二级丙等医院)。1997年10月被国家卫生部、联合国儿童基金会、世界爱婴组织授予爱婴医院称号。