新巴尔虎左旗蒙医医院是在阿尔山庙“曼巴达仓“基础上发展起来的。1957年十几名喇嘛医生合资入股成立了“阿尔山蒙药厂“又称“蒙医合作医院”，1978年被新巴尔虎左旗革命委员会批准为“阿尔山中蒙医院”。1983年新左旗人民政府批准全民所有制医院，改称为“新巴尔虎左旗蒙医医院”，原蒙药厂成为蒙医医院制剂室。是一所集医疗、蒙药制剂、康复养生、预防保健教育为一体的非营利性二级乙等蒙医综合医院。同时挂内蒙古医科大学社会实践教育基地的牌子。也是全市六个蒙中医基层人员培训基地之一。是旗医疗保、合作医疗、人寿保险机构的定点医疗机椅
我院占地面积3.8万平米，建筑面积11700平方米，实际开放床位60张以上。临床科室11个，有心身医学科、心病科、肝胆科、脾冒科妇科、儿科、布病科、五疗科、康复科、治未病科、体检科。

我院核定编制42个，现有职工73人，在编职工38人、同工同酬3人、编外3人、院内聘用9人。其中专业技术人员62名，其中高级专业技术职称14名，中级专业技术职称5人，大专及以上学历61人。自治区级名蒙医1人，呼伦贝尔市级名蒙医1人。全国基层全国基层名老蒙医牧仁传承工作室2017年9月份启动，现有团队15人。医院有五疗科等市级重点专科，以突出特色发挥优势为医院发展战略，建设专病专科为医院发展方向，临床工作中以蒙医药诊治为主，运用蒙药和放血、针刺、蒙古灸疗、药浴、沙盐疗、玉疗、拔罐等数+种蒙医适宜技疗、术，治疗颈椎病腰间盘突出症、慢性腰腿痛症、慢性疲劳症失眠症、风湿性关节炎、类风湿等疾病。
医院继承了阿尔山庙的蒙医药文化，制剂先保留了178种蒙药验方，其中注册蒙药品种134种，其中如达-13、地格达-13、扎冲-13等多种疗效确切的蒙成药。

新左旗蒙医医院工作中不断的开拓进取，求真务实，坚持特色，发挥优势，用高品质的医疗质量，现代化的高端管理，人性化的医疗服务彰显温馨的人文关怀，打造让患者满意.百姓放心医院。