甘南州妇幼保健院始建于1974年5月，是一所集保健、临床、培训、健康教育为一体的公共卫生事业单位，为二级甲等妇幼保健机构，是甘南州儿童康复救助定点医院。承担着全州七县一市妇幼保健技术指导和全州妇女儿童的健康保护任务。建筑面积7121平方米，内设办公室、医务科、后勤保障科、健康教育科、信息科、公共卫生科六个职能管理科室和八个临床科室及四个保健科室（妇产科、内儿科、护理部、药械科、医技科、保健科、计划生育服务科、基层技术指导科，儿童保健科、妇女保健科、围产保健科、中医保健科）。现有职工161人（编制内77人，聘用84人），副高级职称28人，中级职称20人，研究生2人，编制床位150张。

在院党总支的领导下,坚持“用党建引领医院发展、以党性规范医疗行为”的工作思路，医院始终坚持“以保健为中心，以保障生殖健康为目的，保健与临床相结合，面向基层、面向群体、预防为主”的办院方向，坚持“儿童优先，母亲安全”的服务宗旨，服务全州妇女儿童。先后被评为全国优秀爱婴医院、全国三八红旗集体、全国母婴友好医院、西部地区妇幼卫生能力提升项目先进受援机构、甘肃省三八红旗集体、甘肃省省级母婴安全优质服务单位、甘肃省优秀团支部、妇产科荣获甘肃省首个“中国医师节”优秀医师团队称号、儿科荣获甘肃省“优秀医师团队”、甘南州民族团结进步创建工作先进集体、全州精神文明先进单位、甘南州先进基层党组织、甘南州卫生健康工作“先进集体"等。

临床开展的主要业务有妇科、产科、儿科、新生儿科、内科、中医科、口腔等常见病、多发病诊治和妇科微创手术(腹腔镜术)子宫全切、卵巢囊肿摘除术、剖宫产、计划生育手术、利普刀术、无痛人流、无痛分娩、导乐分娩和妇科、产科常见病的理疗治疗，并开展孕产妇危重症及新生儿危重症的监护和治疗。保健主要开展儿童保健科、妇女保健科、围产保健科，并承担全州干部职工健康体检工作。