阿克苏地区中医医院成立于2015年7月，总院和康复中心占地面积227.5亩，建筑面积7.6平方米，是一所集医疗、科研、教学、康复、预防保健为一体的三级综合性中医医院。医院承担着全国中医类实践技能考试任务、自治区”西学中”实践技能培训基地、自治区中医药文化宣传教育基地、阿克苏地区中医适直技术中医推广基地;也是国家中医骨伤优势专科培育单位;还是陕西中医药大学塔里木大学附属医院;是甘肃省中医药大学、新疆理工大学等临床教学基地;是新疆维吾尔自治区中医医院、新疆医科大学第一附属医院医联体协作医院
阿克苏地区中医医院人才梯队合理，现有编制床位600张，开放床位660张，核定编制共660个，在编干部394人，聘用人员234人，共计在岗人员628人(汉族435，少数民族193)，民汉比例1:2.25。卫生专业技术人员555人，其中正高23人，副高43人，中级104人，初级385人。核定内设机构16个，现有临床科室24个，医技科6个，职能科室22个。
阿克苏地区中医医院专科建设发展迅猛，现有现有重点专科13个。其中:自治区级2个(中医骨伤中心、康复中心);地区级11个(中医妇科、中医肺病科、中医骨伤科、针灸推拿康复科、中医心病科、中医内分泌科、中医护理学、老年医学科)。2024年我院中医骨伤科荣获国家中医优势专科培育单位，阿克苏地区保膝中心。医院充分发挥中医药独特优势，应用现代科学技术，走中西结合发展道路，在原骨伤中心、康复中心的基础上，新建6个诊疗中心分别是肺结节、甲状腺结节、乳腺结节、月经病、肿瘤、脑卒中康复诊疗中心，确定中心学科带头人,组建中心团队。八大中心始终坚持中西医并重、传承与创新相结合，能熟练开展快速康复ERAS技术、重蒸、针灸、罐疗、刮痧、穴位注射等高水平中医特色诊疗服务项目100余种，培养造就一支有经验、高水平、专业化护理团队，努力营造温馨舒适的就医环境。
阿克苏地区中医医院党委成立于2015年7月，核定领导职数7名。 2023年9月16日，我院党委圆满完成换届选举工作，选举产生了新一届领导班子，党委委员分别到各党支部任支部书记。党委下设7个党支部，支委均为5人。现有党员159名，其中:退休党员20名、预备党员1名、女性党员92名、少数民族党员19名、专业技术党品121人。
阿克苏地区中医医院医疗设备产全，现有1.5T核磁共振，64排128层和40排(uCT530)螺旋CT、“体外冲击波碎石机”、全身双能量骨密度检测仪、电子胃肠镜、四诊仪等一批高新诊疗设备群，设置9间层流百级、万级手术室和正负压手术室，拥有重症医学科、临床医学实验室等现代化的信息支持系统，为临床诊断治疗提供了强大的技术支撑。
面向新时代，踏上新征程，阿克苏地区中医医院将始终坚持“以质量为中心、以服务为品牌”的发展理念，扎实推进”一院两区、错位发展、各具特色”的发展战略，不断强化“八大中心三大基地“建设和“名医、名科、名院”三名工程，奋力打造南疆区域中医诊疗高地，让老百姓在家门口享受高水平中医药诊疗服务。