昌吉州中医医院建于1988年,建筑面积4.2万平米,是集治疗、预防保健、科研、教学、养生、治未病、康复及中医文化传播为一体的三级甲等中医医院,全国针灸临床研究中心新疆昌吉分中心,自治区院士专家工作站建站单位,中医微创水针刀筋骨针法临床教学基地、国家中医药管理局全科医师和住院医师规范化培训基地协作单位、国家中医专业执业医师考试基地,自治区县级中医民族医临床技术骨干培训基地,自治区中西医结合人才培训基地,自治区中医维吾尔医类别全科医师转岗培训基地,自治区中医全科助理医师规范化培训基地,自治区工伤康复试点医院、昌吉州康复医学中心,医院年门诊量45万人次,出院病人2.5万人次。