北京市东城区妇幼保健院成立于1929年，2017年由原东城区第一妇幼保健院(东四产院)和原东城区第二妇幼保健院(原崇文区妇幼保健院)合并，成立北京市东城区妇幼保健计划生育服务中心，加挂北京市东城区妇幼保健院、北京市东城区东四妇产医院。2023年我院作为成员单位参与建设东城区首家紧密型城市医疗集团，正式纳入“北京市普仁医疗集团”。目前是一家以儿科和妇产科医疗为特色，集儿童保健中医科、口腔科、康复科、内科、体检科于一体的二级妇幼保健院。
医院1992年以全国唯一满分的成绩荣获国家首批“爱要医院”称号，2014年成立了北京中西医结合妇幼保健研究所，2021年创建北京市老年友善医院，2023年通过北京市母婴友好医院验收。
医院总占地面积15512平方米，一院四址。北院区(北京市东四产院)位于交道口南大街136号，沿袭东四产院的历史，定位于妇女基本医疗和保健服务。前身是“北平国立第一助产学校附设产院”，是我国妇幼卫生事业的创始人、助产教育的开拓者、我国原卫生部妇幼司首任司长杨崇瑞博士于1929年亲手创办，是我国最早建立的妇产医院之一南院区位于法华南里25号，沿袭崇文儿童医院的历史，定位于儿童基本医疗和保健服务。前身是崇文区儿童医院，于1958年9月1日正式成立。1999年2月与崇文区妇幼保健所合并成立崇文区妇幼保健院。
绿芽”(婚登婚检一站式)位于玉蜓公园内东城区婚登处，定位于婚登婚检一站式服务;群体保健办公区位于崇文门新怡商务楼B座10层，定位于辖区保健管理。

医院共设有临床和保健科室31个，编制床位158张。群体保健工作覆盖全区助产机构6家、计划生育服务机构14家、社区卫生服务中心10个、保健科6家、托幼机构84家及5家社区办园点的妇幼保健管理工作。医院始终遵循“牺牲精神，造褔人群”的校训，坚持“以保健为中心、以保障生殖健康为目的，保健和临床相结合，面向群体、面向基层和预防为主”的妇幼卫生工作方针，按照全生命周期和三级预防的理念，以一级和二级预防为重点，为妇女儿童提供从出生到老年，内容涵盖生理和心理的主动、连续的妇幼与管理，为辖区内妇女儿童提供健康服务。