菏泽市牡丹区中医医院是一所集医疗、康复、保健、医养结合、科研、教学为一体的二级甲等中医医院,为“市级文明单位”。是菏泽市驻地牡丹区唯一一家二级公立中医医疗机构,并承担着牡丹区残疾人康复服务中心业务工作,现医疗服务人次快速增长。医院现有全国基层名老中医药专家传承工作室一处,省市区名中医26人,骨伤科为山东省中医药重点专科。康复科为山东省县域中医药龙头科室,中风科为市级重点中医专科。市级重点专科建设项目:针灸科、心内科、肿瘤科、治未病科。医院拥有1.5T超导核磁共振、心血管造影机、康复机器人等国内外现代化诊疗设备百余台套。