阜阳市第二人民医院是以感染病诊治为特色的大型三级综合性医院，也是安徽省唯一一家三级甲等传染病专科医院，安徽省公共卫生临床中心（阜阳）、安徽省立医院阜阳医院、安徽医科大学阜阳临床学院、蚌埠医科大学教学医院。

近年来，医院在市委、市政府和市卫生健康委的坚强领导下，坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，全面落实新时代党的卫生与健康工作方针，坚持“以病人为中心，以质量为核心”的办院宗旨，走“强专科、大综合”之路，多项诊疗技术居市领先水平，是皖西北地区医疗、预防、教学、研究中心之一，医疗服务范围辐射周边省、市地区。年门急诊总量达50余万人次，住院病人达5万余人次。      

医院占地面积70亩，编制床位1800张，实际开放床位1200张，现有在职职工1500余人，其中正高级职称人员101名，副高级职称人员345名，中级职称专业技术人员691名，江淮名医5名，安徽省特支计划人才1名，安徽省卫生健康杰出人才1名，安徽省卫生健康骨干人才1名，安徽医科大学硕士生导师7名，安徽医科大学兼职教授9名、副教授8名，颍淮名医17名，阜阳市专业技术拔尖人才22名，阜阳市杰出人才2名，阜阳市创新领军人才3名，阜阳市产业创新团队4个，阜阳市专业技术后备人才30名，“健康阜阳”高层次专业技术人才30名，享受国务院特殊津贴1人、安徽省政府特殊津贴1人、市政府特殊津贴3人。

医院新区——安徽省公共卫生临床中心（阜阳）占地231亩，投资20亿元，一期总建筑面积21万平方米，包括省级区域性感染病救治中心、感染病医师进修教育培训基地、艾滋病临床进修教育基地、感染科专科医师规范化培训基地等“一中心三基地”。目前，该项目主体已封顶，预计2025年可投入使用。 

医院学科齐全。感染病学科包括肝病科（四个病区）、感染病科（两个病区及感染病ICU）；内科系统设有呼吸与危重症医学科（综合病区、感染病区、结核病区、危重症病区）、肾脏病科、血液净化中心、肿瘤内科、心血管内科（两个病区）、神经内科、内分泌科、消化内科、全科医学科/老年病科/血液内科、重症医学科（ICU）内科病区；外科系统设有普通外科、胸心外科、肝胆胰外科、神经外科、泌尿外科、泌尿男科、血管外科、骨科（两个病区）、妇科、产科、皮肤性病科、重症医学科（ICU）外科病区；其它临床学科设有儿科、急诊医学科（内科病区和外科病区）、口腔科、眼科、耳鼻喉头颈外科、康复医学科、中医科、高压氧医学科、麻醉科、手术室、临床营养科、风湿免疫科；医技科室设有CT室、磁共振室、放射科、介入诊疗中心、超声医学科、功能检查科、检验医学科、病理科、内镜诊疗中心、输血科、放射科，以及健康体检中心一所。其中呼吸与危重症医学科、肝病科为安徽省“十二五”临床医学重点培育专科；肾脏病科、胸心外科分别为安徽省“十三五”医疗卫生重点培育专科和重点特色专科；“十四五”期间，呼吸与危重症医学科和感染性疾病科（含肝病科、感染病科）再次被评为安徽省2021年医疗卫生重点专科，肾病科为安徽省2022年度省管市建重点专科，重症医学科（ICU）2023年度被评为省管市建临床重点专科；呼吸与危重症医学科、肝病科和肾脏病科为阜阳市临床医学优先发展学科；心血管内科、骨科、普通外科、泌尿外科、结核病科、重症医学科（ICU）、血液净化科、检验医学科、影像医学科为“十四五”市级临床重点专科。

近年来，呼吸与危重症医学科成功通过国家PCCM认证，下肢静脉曲张微创治疗规范化培训基地落户医院血管外科，肿瘤内科获批“安徽省第四批癌痛规范化治疗示范病房”，骨科二病区建成“无痛病房”。医院消化内科被中华医学会消化内镜分会授予“中国食管胃静脉曲张诊疗规范基地”；2017年7月，医院被中国肝炎防治基金会、中华医学会感染病学分会联合授予“全国干扰素临床应用基地项目医院”。目前，全院已形成“心肝骨肺肾，重症加感染”优势学科群。呼吸与危重症医学科、肝病科、骨科、胸心外科、医学检验科、肾脏病科、心血管内科七个学科为安徽医科大学硕士生培养点，全科医学科为安徽省全科医师培养基地，感染性疾病科为阜阳市住院医师感染病规范化培训基地，阜阳市呼吸内科、肺癌、感染病、肾脏病、血液净化、结核病、重症医学等七个医疗质量控制中心挂靠医院.    

医院设备先进。拥有西门子3.0T及飞利浦、联影1.5T超高端磁共振3台；瓦里安直线加速器1台；CT设备6台，分别为通用医疗（GE）256排CT、飞利浦64排、东芝64排、通用医疗（GE）16排、东软16排方舱CT、明峰16排方舱CT;介入诊疗中心拥有西门子及飞利浦DSA3台；放射科配备通用医疗高端数字摄片机(DR)、岛津动态平板数字胃肠机、移动DR等10余台；超声医学科拥有飞利浦、三星、迈瑞等先进数字化多功能高档超声诊断仪15台；检验医学科现拥有日立7600型全自动生化流水线、罗氏cobas480全自动高敏PCR检测系统，重庆中元EXS3000时间飞行质谱仪、BD-960分支杆菌培养鉴定仪、GeneXpert结核分枝杆菌和利福平耐药分子分析系统等一大批先进检验设备。内镜诊疗中心拥有奥林巴斯、宾得等高清内镜主机9套，配有相关内镜34条；血液净化中心拥有血液透析机、血液滤过机90余台，连续性血液净化设备10台；手术室配有超高清腹腔镜、宫腔镜、十二指肠镜、输尿管软镜、手术显微镜等20余台；全院共有有创及无创呼吸机100余台；高流量呼吸湿化治疗仪100余台；重症医学科配有体外生命支持系统（ECMO）及转运(ECMO)共3台、有创及无创呼吸机100余台；高流量呼吸湿化治疗仪100余台，能够充分满足患者诊疗需要。  

诊疗技术先进。近年全院开展新项目、新技术200余项，其中体外膜肺氧合（ECMO），导管主动脉瓣置换术（TAVR），左束支区域起搏术，脊柱截骨矫形术治疗重度脊柱侧弯，OLIF治疗脊柱退行性疾病，感染性髋、膝关节置换术后翻修术，内固定及椎间融合术治疗脊柱结核，腹膜透析置管术，超声引导下肾穿刺活检术，中心静脉覆膜支架植入术，动静脉内瘘动脉瘤体去顶缝合术，乙肝/丙肝高敏病毒检测，乙肝治愈，肝纤维化无创检测，肝癌微波消融和TACE术，肝硬化门脉高压内镜下食道胃底静脉曲张套扎/硬化术，人工肝治疗技术，超声支气管镜引导下纵膈肺门淋巴结穿刺术，超细支气管镜联合超声小探头诊断肺外周病变术，硬质气管镜检查术，气道肿瘤冷热消融术，布加氏综合征介入治疗，气道支架植入技术治疗良恶性气道狭窄，结核病分子诊断术：Xpert、Lamp、溶解曲线，超声内镜下胰腺穿刺术，内镜下阑尾炎支架置入术及冲洗术，内镜下内痔套扎及硬化术，内镜下消化道早癌切除术，内镜下消化道支架置入术，内镜下食管胃底静脉曲张套扎硬化及组织胶注射术等，或填补了阜阳市内空白，或处于全市领先水平。

科研成果丰硕。近年来，医院获批省、市科研立项课题62项，其中2019年市卫健委立项课题17项；2020年市科技局应急攻关课题13项，市科技局自筹课题11项；2021年市卫生健康委立项课题18项；2022年省卫生健康委立项课题2项；省科技厅应急攻关项目1项。“十三五”期间获市科技进步二等奖一项，结题16项。2019年至2022年共发表科技核心以上级别学术论文277篇，其中SCI论文71篇。

应对公共卫生事件成效卓著。近年来，医院坚持以高质量党建引领高质量发展，多次成功有效应对非典、人禽流感、手足口病、甲型H1N1流感等突发公共卫生事件重症病人应急救治工作。尤其是在2020年新冠肺炎疫情防治工作中，医院作为阜阳市新冠肺炎定点收治医院和安徽省四大重型/危重型病例救治基地医院之一，共接收156例本市确诊病例及市外转入的4例重型病例全部治愈出院，成为全省收治新冠患者数最多、危重症患者最多、治愈出院的人数最多的医院，实现了全收治、全治愈、无院内感染“两全一无”目标。2022年共收治03·26阜阳、06·26泗县、09·23阜阳颍州区、10·07太和县、淮北市濉溪县、合肥市长丰县等地疫情患者3000余例。2020年以来，还先后抽调专业技术人员支援武汉、河南禹州、六安、淮南等地和北京海关、云南航空等地疫情防控工作，为保障群众的健康及生命安全做出了突出贡献。

近年来，医院先后荣获安徽省文明单位、全国医院文化建设先进单位、安徽省劳动竞赛先进集体 预约挂号