温州市中医院前身是1923年创办的“专以施医施药救济贫病者”为宗旨的医疗慈善机构——永嘉募办普安施医施药局。经过百年的发展，现已建设成为国家三级甲等中医医院、全国“文明单位”、省级“平安医院”“绿色医院”；先后被授予“全国节约型公共机构示范单位”“全国改善医疗服务示范医院”“全国两化融合示范点创建单位”称号；医院承担浙南地区中医医疗、教学、科研、培训、养生、保健等任务，成功入选“国家中医特色重点医院建设项目”“浙江省现代医院管理制度试点单位”，2018年-2022年连续五年获得国家三级公立医院绩效考核A等评价；2022年，成立“温州市慈善总会温州市中医院普安分会”，着力打造“慈善医院”品牌。
医院现有职工1660余人，总占地面积112.7亩，建筑面积13.4万平方米，拥有六虹桥、景山、水心、龙湾四大院区，总开放床位超过1400张。2015年，组建成立温州市中医医疗集团；2016年，与上海复星医药集团合作，对原大士门院区进行改制建立“温州老年病医院”；2018年，全面托管泰顺县中医院；2022年，成立温州市康复医学研究院、康复医学培训中心、康复护理技能培训中心。2023年4月，水心院区拆扩建工程全面启动；2023年5月，挂牌浙江中医药大学同质化管理附属医院、浙江中医药大学温州临床医学院、浙江省名中医研究院温州分中心、温州市名中医研究院、永嘉医派研究院。医院学科地区辐射性强，现有国家级重点专科4个——中医妇科、肾病科、康复科、神志病科；省中医重点学(专)科9个——中医妇科、肾病科、中西医结合老年康复科、肝病科、针推康复科、脑病科、脾胃病科（消化科）、骨伤科、护理学；市级重点学科群4个——老年病学科群、康复医学学科群、心脑血管学科群、骨伤学科群；市级重点学（专）科11个——心脑血管科、康复科、骨伤科、中西医结合乳腺病科、中西医结合消化内科、针灸推拿科、检验科、中西医结合皮肤科、中医外科、中西医结合肿瘤内科、中西医结合心血管内科。建立了石学敏、葛琳仪等多个院士、国医大师温州工作站及国家、省市名中医工作室，开设了生物等效性研究中心、中医药科研实验中心、浙江省中医药重点实验室（培育），保持了在地区中医药发展建设中的领先地位。
全体中医院人以“大医精诚、仁术普安”为院训，践行“传承、创新、安全、优质、智慧、高效、文明、幸福”的医院核心价值观，向着打造 “省内一流、全国知名”的现代化国家三级甲等中医院的目标奋力前行。
六虹桥院区
六虹桥院区位于六虹桥蛟尾路9号，总开放床位946张。一期占地面积23亩，建筑面积6.48万平方米，2015年4月正式开诊。二期占地面积17.26亩，建筑面积3.03万平方米，于2017年10月底投入使用。该院区服务范围向西延伸，拥有先进的诊疗设备，提供完善的中西医结合临床服务，享有良好的群众口碑，系医院核心院区。
景山院区
景山院区位于雪山路338号，占地面积41.5亩，建筑面积1.1万平方米，前身为温州市气功疗养院，1999年整体并入我院。2000年与中国康复研究中心共同创建了“中国康复研究中心温州分中心”；2022年温州市康复医学研究院、康复医学培训中心、康复护理技能中心在景山院区挂牌；长期接受中国康复研究中心的业务指导与技术培训，是浙江省内规模较大，科室配置齐全, 设备精良、技术力量较雄厚的综合性康复中心之一。
水心院区
水心院区位于锦绣路1024号，占地面积21亩，建筑面积1.09万平方米。2013年1月1日，我院兼并温州市第八人民医院后组建水心院区，开创了我市中医医院兼并综合性医院的先河，在医疗资源整合的道路上迈出了跨越式的一步。2015年9月，中医妇科门诊和病房整体搬迁至水心院区，并将住院床位扩张至128张，重点打造中西医结合妇产科医院；2021年，我院入选国家中医特色重点医院建设项目，项目对应的水心院区改扩建工程纳入国家中医重点《浙江中医药发展“十四五”规划》，2023年已全面启动拆扩建工程。
龙湾院区
龙湾院区位于龙湾区龙水路99号（亲和雅园），于2022年6月正式开诊。院区开设中医妇科、中医骨科、中医内科、针灸推拿科、康复理疗科、耳鼻喉科、眼科等特色专科门诊，配备药房、输液、检验、放射等医技部门。2023年4月，随着水心院区拆扩建工程的动工，妇科病区整体搬迁至龙湾院区。
温州市中医院城市医联体
2021年3月，温州市中医院城市医联体成立，医联体成员单位包括：鹿城区水心社区卫生服务中心、鹿城区南浦社区卫生服务中心、鹿城区南郊社区卫生服务中心、瓯海区中西医结合医院、瓯海区人民医院等5家。温州市中医院为总院，医联体成员单位增挂“温州市中医院城市医联体分院”牌子，分别命名为松台水心分院、南浦分院、南郊分院、新桥分院、将军分院；2021年9月在松台水心分院开设全市首个城市医联体联合病房（康复综合内科）。城市医联体实行优质医疗资源下沉帮扶，基层医疗人员向上学习的上下联动模式，形成了基层首诊、双向转诊、急慢分治的诊疗体系。
原大士门院区
大士门院区坐落于温州市区风景秀丽的松台山麓、九山湖畔，占地面积10亩，建筑面积15577㎡。医院于1971年迁入大士门27号，设有内、外、妇、儿、ICU、感染科、骨伤、肛肠、耳鼻喉、眼、针灸、推拿、康复、口腔、皮肤科等一级科室，开设肾病、肝病、消化、呼吸、肿瘤、心脑血管等病区。2015年4月医院搬迁至六虹桥新院区后，于2016年6月与上海复星医院投资（集团）有限公司合作，在大士门院区创建“温州老年病医院”。
